提醒一：个体、个独负责人、合伙企业的个人合伙人取得的所得缴纳个税有两个税目：“经营所得”、“利息、股息、红利所得”，并没有“工资、薪金所得”这个税目。因此在计算经营所得应纳税所得额时，个体、个独负责人、合伙企业的个人合伙人的工资薪金支出不能扣除。 

提醒二：根据《中华人民共和国个人所得税法》、《财政部国家税务总局关于合伙企业合伙人所得税问题的通知》（财税〔2008〕159号）和《个体工商户个人所得税计税办法》（国家税务总局令第35号）的规定，合伙企业合伙人从合伙企业取得的所得，应比照“经营所得”计算缴纳个人所得税，不属于工资薪金所得。

提醒三：业主（或者合伙人）每月领取的“工资”，实质是经营所得，提前领取而已。

提醒四：若是给投资人（或者合伙人）发放了工资薪金，在计算个体户、个人独资企业负责人以及合伙企业合伙人的应纳税所得额时，应将投资人（或者合伙人）的工资调增个体户、个人独资企业、合伙企业的经营所得后确定应纳税所得额，然后由自然人投资者按照经营所得计税办法计算个人所得税。

参考

参考一：北京税务答疑：合伙企业的合伙人是自然人，在公司任职，能按工资薪金扣缴个人所得税吗？

答：根据《中华人民共和国个人所得税法》、《财政部 国家税务总局关于合伙企业合伙人所得税问题的通知》（财税〔2008〕159号）和《个体工商户个人所得税计税办法》（国家税务总局令第35号）的规定，合伙企业合伙人从合伙企业取得的所得，应比照“经营所得”计算缴纳个人所得税，不属于工资薪金所得。

参考二：根据《个体工商户个人所得税计税办法》（国家税务总局令第35号）第二十一条规定：个体工商户实际支付给从业人员的、合理的工资薪金支出，准予扣除。个体工商户业主的费用扣除标准，依照相关法律、法规和政策规定执行。个体工商户业主的工资薪金支出不得税前扣除。

参考三：

问：

1、个体工商户户主本人的工资、薪金要不要通过《自然人税收管理系统扣缴客户端》申报代扣代缴个人所得税？还是通过经营所得直接扣减6万元费用申报，不通过综合所得申报？

2、个体工商户下面的从业人员的工资、薪金要不要通过《自然人税收管理系统扣缴客户端》申报代扣代缴个人所得税？

答：根据《个体工商户个人所得税计税办法》(国家税务总局令第35号)第二十一条的规定，个体工商户实际支付给从业人员的、合理的工资薪金支出，准予扣除。个体工商户业主的费用扣除标准，依照相关法律、法规和政策规定执行。个体工商户业主的工资薪金支出不得税前扣除。个体工商户的从业人员也应当通过自然人税收管理系统扣缴客户端申报代扣代缴个人所得税。